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Documentos e artigos disponíveis para consulta:

AULAS Genética Populacional e Filogeografia

Os pdf das aulas poderão ser consultados aqui:

Aulas teóricas

1. Aula sobre Estrutura e hereditatiedade dos genomas, Variação genética, Métodos para detecção da variação genética Ver aula


2. Equilíbrio de Hardy-Weinberg, Deriva genética, Mutação Ver aula


3. Estrutura Populacional Ver aula


4. Coalescência Ver aula


5. Desequilíbrio Gamético Ver aula


6. Selecção Ver aula


7. Filogeografia; Perspectiva histórica, métodos de análise Ver aula


8. Especiação Ver aula

Bibliografia

1. Nordborg - Coalescent theory Ver artigo
2. Rosenberg e Nordborg - Genealogical trees, coalescent theory Ver artigo
3. Donnely - Genealogical trees, coalescent theory Ver artigo
4. Ardlie e Kruglyak - Patterns of linkage disequilibrium Ver artigo
5. Nachman - The genetic basis of adaptation Ver artigo
6. Hedrick - Genetic polymorphism in heterogeneous environments. Ver artigo
7. Bamshad e Wooding - Signatures of natural selection. Ver artigo
8. Ascroft - Identifying refugia from climate change. Ver artigo
9. Avise et al. - Speciation durations and Pleistocene effects on vertebrate phylogeography. Ver artigo
10. Beheregaray - Twenty years of phylogeography. Ver artigo
11. Carstens & Richards - Integrating coalescent and ecological niche modeling in comparative phylogeography. Ver artigo
12. Carstens & Knowles - Shifting distributions and speciation. Ver artigo
13. Weiss & Ferrand - Current perspectives in phylogeography and the significance of South European refugia. Ver artigo
14. Crisp et al.- Hypothesis testing in biogeography. Ver artigo
15. Hewitt- The genetic legacy of the Quaternary ice ages. Ver artigo
16. Hewitt- Some genetic consequences of ice ages, and their role,in divergence and speciation. Ver artigo
17. Hewitt- Post-glacial re-colonization of European biota. Ver artigo
18. Hewitt- Speciation, hybrid zones and phylogeography. Ver artigo
19. Knowles & Carstens- Estimating a geographically explicit model of population divergence. Ver artigo
20. Knowles - Statistical Phylogeography. Ver artigo
21. Gómez & Lunt - Refugia within refugia. Ver artigo

Aulas práticas

1. Variação genética (dados alélicos) Ver aula


2. Variação genética, Redes de Haplótipos e Distâncias Genéticas (sequências) (dados alélicos) Ver aula


3. Estruturação Populacional (dados alélicos); Métodos Bayesianos de agrupamentos multilocus Ver aula


4. Estruturação Populacional e Demografia (sequências) Ver aula


5. Especiação e Demografia Ver aula

Instruções de Avaliação

Ver exemplo de avaliação aqui.

Ficheiro example.pdf

ARTIGOS - Métodos Moleculares na Análise Diversidade Biológica

Artigos de revisão para consulta relativos à componente tutorial da disciplina (lista ainda incompleta):

1. Genomics and the future of conservation genetics. Ver artigo


2. Adaptation Genomics: the next generation. Ver artigo


3. The power and promise of population genomics: from genotyping to genome typing. Ver artigo


4. Biodiversity assessment using markers for ecologically important traits. Ver artigo


5. DNA-based methods for pedigree reconstruction and kinship analysis in natural populations. Ver artigo


6. Population Genomics of Parallel Adaptation in Threespine Stickleback using Sequenced RAD Tags. Ver artigo


7. The evolution of molecular markers - just a matter of fashion?. Ver artigo


8. Efficient genetic markers for population biology. Ver artigo


9. Noninvasive genetic sampling: look before you leap. Ver artigo


10. Which genetic marker for which conservation genetics issue? Ver artigo